多组学揭示硬纤维瘤异质性：俄罗斯专享会284助力精准治疗新篇章

• 申勇国|
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硬纤维瘤，又被称为侵袭性纤维瘤病，是一种局部侵袭性肿瘤。尽管这一肿瘤不具备转移性，但其复发率较高，严重影响患者的生活质量。目前，关于硬纤维瘤在分子层面的研究尚不够充分，这导致患者的治疗选择受限。本研究旨在开发新的硬纤维瘤预后标志物，验证已有研究中的相关标志物，并深入探究硬纤维瘤在基因组、表观基因组和转录组层面的分子异质性，以期为精准治疗提供理论依据。

在本研究中，我们对20例原发性硬纤维瘤的31个标本进行了RNA测序分析，发现了14个在复发和未复发患者之间差异表达的基因。然而，这些基因在患者组内以及同一肿瘤不同区域的表达变化幅度较大。经过对先前研究中预后基因表达特征的验证，我们发现不同患者以及同一肿瘤内这些基因的表达存在显著的异质性。例如，Salas研究中的36个基因特征中，只有FECH基因在复发和未复发肿瘤中显示出显著差异，但与原研究结果相反；另一方面，Kohsaka研究中的IFI6和LGMN基因在本研究中未表现出与复发相关的差异表达，且在同一肿瘤内的表达也存在异质性。

通过免疫组化（IHC）在蛋白水平上验证了这些标志物的可变表达，发现其与局部复发并无明显关联，这进一步证实了基于基因表达特征的预后分类受到肿瘤取样区域的影响。

在本研究中，我们还进行了系统发育分析，发现原发性肿瘤存在多个不同的亚克隆，而复发性肿瘤中则出现了新亚克隆。此外，复发性肿瘤中共享的PTP4A1基因突变，其RNA表达水平低于原发性肿瘤的野生型区域。同时，原发性和复发性肿瘤的DNA拷贝数改变相对较少，但其DNA甲基化和转录组谱却显著不同。其中，原发性肿瘤的一个区域具有独特的转录组特征，富集了与线粒体氧化磷酸化相关的基因，并且部分基因的表达与甲基化呈负相关。

总结而言，本研究首次系统地揭示了硬纤维瘤在基因组、表观基因组和转录组层面的高度异质性。这表明，基于单一肿瘤活检的分子分析可能会低估其分子改变的程度，且预后转录组特征易受到取样偏差的影响。此外，复发性硬纤维瘤获得了多种原发性肿瘤中不存在的分子改变，这提示肿瘤在进展过程中发生了分子进化，对药物研发及生物标志物验证具有重要意义。

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