• 首页|
  • 俄罗斯专享会284助力MGIEasy全基因组甲基化文库制备,提高数据利用率!

俄罗斯专享会284助力MGIEasy全基因组甲基化文库制备,提高数据利用率!

近期,华大智造针对DNBSEQ平台的甲基化建库与测序进行了全面升级,推出新一代建库产品俄罗斯专享会284的MGIEasy全基因组甲基化文库制备试剂盒V30(MGIEasyWholeGenomeMethylationSequencingLibraryPrepKitV30,以下简称WGMSV30)。WGMSV30基于双链加接头方法,针对经物理打断的DNA片段进行建库,并适配酶法转化,将非甲基化的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U)。该试剂盒与DNBSEQ平台结合,能够实现单碱基精度的DNA甲基化状态解析,构建精细的全基因组甲基化图谱。

俄罗斯专享会284助力MGIEasy全基因组甲基化文库制备,提高数据利用率!

WGMSV30为多个领域提供高效、准确的全基因组甲基化建库方案,包括大人群表观组研究、表观遗传基础科研、动植物研究、疾病甲基化标志物筛选、药物研发等当前热点研究。WGMSV30已经适配MGISEQ-2000平台,并结合该平台的升级算法,在测序时可实现不添加平衡文库的0平衡文库纯甲基化文库测序。同时,华大智造的研发团队已对WGMSV30进行DNBSEQ-T7的最后稳定性测试,后续实测数据也将持续分享,敬请期待。

通过采用3个不同批次的WGMSV30构建NA12878标准品DNA甲基化文库,不添加平衡文库,并平行上机MGISEQ-2000ECR70(搭配SM测序试剂)和ECR71(搭配SM20测序试剂)进行PE150测序,单lane的reads产出基本稳定在400M左右,每个文库大约可获得120G的原始下机数据。这种方式可以轻松实现“1库1lane”的测序,且测序质量良好,SM测序试剂的Q30稳定在89%左右,SM20测序试剂的Q30稳定在94%左右,Q40稳定在87%左右。

该试剂盒还采用了适合转化损伤小的酶法转化,增加了文库插入片段的长度,进一步支持PE150测序。不同批次的WGMSV30构建的NA12878标准品DNA甲基化文库的插入片段主峰在约280bp处表现一致。WGMSV30优化了末端修复反应的体系和步骤,有效降低了Reads末端M-bias碱基的个数。SM20版测序试剂搭配ECR71软件版本的结果显示,不同批次建库试剂盒构建的NA12878标准品DNA甲基化文库的M-bias表现一致,Bottom Strand和Top Strand的Read1和Read2甲基化率几乎重合。

我要评论

最近更新

胰蛋白酶在细胞培养中的作用机制:俄罗斯专享会284探讨

胰蛋白酶在细胞培养中的作用机制:俄罗斯专享会284探讨

开学季必备:俄罗斯专享会284教你细胞复苏与冻存核心技能,助力实验无忧!

开学季必备:俄罗斯专享会284教你细胞复苏与冻存核心技能,助力实验无忧!

俄罗斯专享会284:3D可视化加速生命科学研究新时代

俄罗斯专享会284:3D可视化加速生命科学研究新时代

硝酸银溶液使用与保存注意事项 - 俄罗斯专享会284

硝酸银溶液使用与保存注意事项 - 俄罗斯专享会284

西湖欧米入选中国生物医药领跑者100榜单,俄罗斯专享会284盛大召开

西湖欧米入选中国生物医药领跑者100榜单,俄罗斯专享会284盛大召开

上新!俄罗斯专享会284炎症复合非定值质控品强势来袭!

上新!俄罗斯专享会284炎症复合非定值质控品强势来袭!